Het arbeidzaam leven van A. Winkler Prins werd beheerst door zijn noeste arbeid aan de 16-delige Nederlandsche Geïllustreerde Encyclopaedie die hij in 1881 voltooide.
In die tijd was landelijk bekend dat Winkler Prins lid was van de Orde van Vrijmetselaren. Dit viel niet in goede aarde bij rooms-katholieke opiniemakers.
Het Dompertje van den ouden Valentijn, een Rooms en antisemitisch periodiek met 'kritisch-historische bijdragen tot de geschiedenis van den dag', ziet in de encyclopedie:

... een joods-maçonniek complot om de waarheid te vervalschen, de geschiedenis te verdraaien, het Christendom te ondermijnen, propaganda  te maken voor het ongeloof  en het materialisme, de openbare meening te bewerken, het opkomend Geslacht te bederven en voor de meer gevorderden een soort van neutrale school  te vormen waar zij een voortgezet herhalingsonderwijs volgens den geest der loge uit kunnen putten, en zoodoende de gansche maatschappij rijp maken voor het  moderne heidendom.

Onvermoeibaar vervolgt Het Dompertje:
Geen Katholiek mag dien Encyclopaedie in het boekrek zijner huiskamer laten staan, want het is eene verzameling van allerlei giftige recepten. Wil een man van studie dien Encyclopaedie toch aanschaffen, hij sluite ze dan in zijn gesloten boekenrij, opdat het geloof zijner kinderen er geen aanstoot aan ontmoete.
Het werk van de maçon Winkler Prins is een gluiperige indringer met een zoetsappige huichelaarstronie die een zalvend humaniteitsgefemel ten toon spreidt.
Het werk in handen geven van jonge onderwijzers houd ik voor een allergevaarlijkst spel, veel gevaarlijker dan aan een jongen van acht of tien jaaren een scherpen dolk, of een scheermes toe te vertrouwen (…).